15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3901 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3901  hypothetical protein  100 
 
 
382 aa  750    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1276  Ycf66 family protein  69.89 
 
 
313 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268194  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2526  hypothetical protein  63.81 
 
 
251 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.766942 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0481  Ycf66 family protein  61.11 
 
 
443 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2673  Ycf66 family protein  57.61 
 
 
372 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3431  Ycf66 family protein  56.52 
 
 
372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4866  Ycf66 family protein  60.98 
 
 
365 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2438  CheA signal transduction histidine kinase  42.19 
 
 
477 aa  74.7  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149631  normal  0.0919681 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0519  Ycf66-like  25.66 
 
 
301 aa  49.7  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0370943  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1483  Ycf66 family protein  30.11 
 
 
279 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0055  Ycf66 family protein  28.16 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4014  Ycf66 family protein  27.37 
 
 
319 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.53651 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0065  hypothetical protein  26.67 
 
 
308 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3467  Ycf66 family protein  26.21 
 
 
299 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2650  Ycf66 family protein  26.21 
 
 
299 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.093415 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>