21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2742 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2742  ChaB family protein  100 
 
 
131 aa  265  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.764397  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5498  hypothetical protein  75.83 
 
 
130 aa  193  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00390859  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14450  hypothetical protein  68.7 
 
 
136 aa  174  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.408221  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3652  ChaB  67.19 
 
 
139 aa  173  6e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3725  ChaB family protein  67.19 
 
 
139 aa  173  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0893  hypothetical protein  66.42 
 
 
134 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1756  hypothetical protein  66.67 
 
 
134 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.721453  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4587  ChaB family protein  65.19 
 
 
138 aa  170  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3665  ChaB family protein  65.62 
 
 
139 aa  168  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0793  ChaB family protein  65.87 
 
 
139 aa  165  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1742  hypothetical protein  64.39 
 
 
137 aa  164  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198279  hitchhiker  0.00269492 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2019  ChaB family protein  61.59 
 
 
142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742631  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1538  hypothetical protein  67.69 
 
 
153 aa  154  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.213562  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3411  hypothetical protein  60.63 
 
 
141 aa  153  9e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1804  hypothetical protein  61.67 
 
 
133 aa  152  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0871  ChaB family protein  57.03 
 
 
140 aa  142  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3007  ChaB family protein  59.52 
 
 
141 aa  141  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000471912  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02480  ChaB protein  56.69 
 
 
141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4490  ChaB family protein  58.27 
 
 
134 aa  134  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0526847 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0646  hypothetical protein  57.89 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212732  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2785  ChaB  42.86 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.167104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>