22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2738 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2738  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  396  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7897  hypothetical protein  69.35 
 
 
198 aa  275  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1798  hypothetical protein  45.9 
 
 
194 aa  169  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0571  hypothetical protein  52.54 
 
 
191 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0889  hypothetical protein  50.29 
 
 
272 aa  162  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0809  hypothetical protein  46.63 
 
 
189 aa  158  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.184742  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6481  hypothetical protein  48.59 
 
 
299 aa  158  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459745  normal  0.157533 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16870  hypothetical protein  47.75 
 
 
200 aa  156  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541123  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0331  hypothetical protein  45.95 
 
 
366 aa  155  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0989  hypothetical protein  45.25 
 
 
183 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3582  hypothetical protein  44.63 
 
 
194 aa  148  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2833  hypothetical protein  42.71 
 
 
231 aa  144  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.281576  decreased coverage  0.00256683 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0979  hypothetical protein  43.58 
 
 
183 aa  141  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128032  normal  0.0985074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0961  hypothetical protein  43.58 
 
 
183 aa  141  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193849  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3962  hypothetical protein  40.74 
 
 
194 aa  131  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0478581  normal  0.244744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4387  hypothetical protein  43.09 
 
 
185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2864  hypothetical protein  28.16 
 
 
241 aa  58.2  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.197887  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1190  hypothetical protein  26.11 
 
 
264 aa  55.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1702  hypothetical protein  25.84 
 
 
270 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0196867  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0491  hypothetical protein  27.78 
 
 
182 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.754962  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2769  hypothetical protein  22.91 
 
 
267 aa  42  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0483  hypothetical protein  26.24 
 
 
272 aa  41.6  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>