11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2466 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2466  rod shape-determining protein MreD  100 
 
 		 170 aa  325  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7280  hypothetical protein  45.28 
 
 		 176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.283498 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1541  rod shape-determining protein MreD  45.1 
 
 		 193 aa  95.9  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.110151  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0851  rod shape-determining protein MreD  49.32 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7283  rod shape-determining protein MreD  40.43 
 
 		 193 aa  60.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0750  rod shape-determining protein MreD  48.21 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3463  rod shape-determining protein  42.39 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0895457  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1213  rod shape-determining protein  38.39 
 
 		 180 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5267  putative rod shape-determining protein MreD; putative membrane protein  50 
 
 		 178 aa  50.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1464  hypothetical protein  50 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2561  rod shape-determining protein MreD  28.83 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0143656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>