20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0392 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0392  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  306  4e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.2643  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1403  hypothetical protein  45.93 
 
 
141 aa  136  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.628547  normal  0.692701 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13970  hypothetical protein  41.73 
 
 
211 aa  114  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.607556 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3765  hypothetical protein  35.29 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3329  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  77  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3607  hypothetical protein  41.41 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.9799  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46310  hypothetical protein  32.84 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.123911  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2149  hypothetical protein  32.84 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167066  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2092  hypothetical protein  32.85 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1372  hypothetical protein  33.11 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2467  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4776  hypothetical protein  29.85 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268249 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2135  hypothetical protein  32.12 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0925  hypothetical protein  39.36 
 
 
118 aa  67.8  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2062  hypothetical protein  29.46 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0457353  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3744  phosphoribosyltransferase-like protein  31.88 
 
 
418 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0623345 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0342  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0076  hypothetical protein  32.82 
 
 
168 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2280  hypothetical protein  37.5 
 
 
142 aa  54.3  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1294  hypothetical protein  25.87 
 
 
145 aa  50.8  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0137379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>