44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2769 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2904  hypothetical protein  59.4 
 
 		 924 aa  943    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.365436 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1022  hypothetical protein  58.52 
 
 		 925 aa  917    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.52068  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0685  double-transmembrane region-like  57.07 
 
 		 919 aa  950    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.621898  normal  0.74897 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0205  hypothetical protein  58 
 
 		 921 aa  943    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.556354 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2683  hypothetical protein  58.41 
 
 		 925 aa  917    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.574694 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2769  double-transmembrane region-like  100 
 
 		 929 aa  1815    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.676495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2232  hypothetical protein  43.12 
 
 		 939 aa  627  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.610589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3058  hypothetical protein  38.95 
 
 		 937 aa  558  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0693886 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2794  hypothetical protein  39.02 
 
 		 937 aa  557  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.749604  normal  0.246775 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1734  hypothetical protein  39.71 
 
 		 945 aa  548  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.093784 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3232  hypothetical protein  38.45 
 
 		 942 aa  544  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.708508  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1558  hypothetical protein  37.23 
 
 		 949 aa  533  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1506  hypothetical protein  37.02 
 
 		 948 aa  530  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.446295  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2842  hypothetical protein  38.53 
 
 		 939 aa  527  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2277  hypothetical protein  38.88 
 
 		 937 aa  527  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30304  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0723  hypothetical protein  41.15 
 
 		 914 aa  529  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1457  hypothetical protein  39.92 
 
 		 945 aa  528  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.109883 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1454  hypothetical protein  40.19 
 
 		 943 aa  520  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.332859  normal  0.622098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5169  hypothetical protein  40.75 
 
 		 939 aa  521  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.165999  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1293  double-transmembrane region-like  37.79 
 
 		 941 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.397525 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2269  hypothetical protein  37.38 
 
 		 940 aa  519  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.501234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4482  hypothetical protein  40.72 
 
 		 941 aa  511  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.792341  hitchhiker  0.00755842 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3637  hypothetical protein  39.59 
 
 		 939 aa  509  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.504486  normal  0.363104 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1374  hypothetical protein  38.28 
 
 		 941 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.347989  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1607  hypothetical protein  36.19 
 
 		 957 aa  504  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557026  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2181  hypothetical protein  38.89 
 
 		 942 aa  503  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647375  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0914  double-transmembrane region-like  38.03 
 
 		 958 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3253  double-transmembrane region-like  37.76 
 
 		 938 aa  490  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.331442  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1190  double-transmembrane region-like  37.23 
 
 		 941 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.546813 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0371  double-transmembrane region-like  39.1 
 
 		 927 aa  464  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.601757  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3903  hypothetical protein  47.8 
 
 		 639 aa  449  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.436608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1009  hypothetical protein  31.94 
 
 		 932 aa  409  1e-113  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.479574  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2005  hypothetical protein  31.79 
 
 		 892 aa  310  8e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3904  hypothetical protein  61.2 
 
 		 279 aa  309  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0103239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3011  hypothetical protein  40.62 
 
 		 940 aa  282  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0470546  normal  0.329062 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2628  double-transmembrane region  36.05 
 
 		 937 aa  276  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2946  hypothetical protein  35.85 
 
 		 943 aa  268  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.575307  normal  0.59944 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2547  hypothetical protein  36.78 
 
 		 255 aa  99.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1222  hypothetical protein  37.66 
 
 		 256 aa  98.2  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.371276  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2644  hypothetical protein  36.82 
 
 		 256 aa  96.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0827849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2738  hypothetical protein  36.82 
 
 		 259 aa  96.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.305966  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4089  hypothetical protein  33.88 
 
 		 280 aa  97.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.0383988 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  27.91 
 
 		 316 aa  55.5  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4420  hypothetical protein  29.41 
 
 		 720 aa  45.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>