36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1082 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1082  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  307  2e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1663  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.79 
 
 		 108 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.285539  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1183  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.79 
 
 		 108 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1637  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.79 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0741559 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3428  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.96 
 
 		 107 aa  97.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0006  hypothetical protein  50.52 
 
 		 107 aa  97.4  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0720243  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3461  hypothetical protein  44.12 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3946  phosphatase  43.81 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2929  hypothetical protein  45.63 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.57185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2603  hypothetical protein  43.81 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1644  protein tyrosine phosphatase-like protein  45.63 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.294535  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1581  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.86 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.285184 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4811  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.63 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.572747 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7132  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.63 
 
 		 109 aa  94  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1380  hypothetical protein  45.1 
 
 		 107 aa  93.6  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4802  hypothetical protein  45.1 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3038  hypothetical protein  42.31 
 
 		 112 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.959689 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1562  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.12 
 
 		 108 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2810  hypothetical protein  41.75 
 
 		 112 aa  87  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.984704 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44960  hypothetical protein  43.88 
 
 		 109 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3825  hypothetical protein  41.84 
 
 		 109 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.417534  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0718  hypothetical protein  39.22 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0770417 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3432  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.62 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.284191  normal  0.553808 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2559  phosphatase  35.58 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4364  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.24 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.969843  normal  0.301624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3543  hypothetical protein  40.57 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02886  phosphatase  37.36 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3901  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.39 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0160871 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1113  protein-tyrosine-phosphatase  33.33 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0412586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2721  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.58 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.203534  normal  0.0645973 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0174  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.86 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0119958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0189  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.78 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00160916  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0174  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.78 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0497104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0181  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.78 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4974  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000359638 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1065  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  29 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>