17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2521 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2521  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  166  7e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0165247 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0133  hypothetical protein  67.5 
 
 
95 aa  114  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1572  hypothetical protein  57.5 
 
 
84 aa  100  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.667787  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0698  hypothetical protein  55 
 
 
83 aa  95.5  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2433  hypothetical protein  51.25 
 
 
90 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.776555  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0275  hypothetical protein  50 
 
 
83 aa  87.4  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0227705  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1394  hypothetical protein  50 
 
 
88 aa  77  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0852964  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3122  hypothetical protein  50 
 
 
94 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1963  hypothetical protein  52.78 
 
 
96 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2340  hypothetical protein  47.44 
 
 
85 aa  68.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.190465  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1932  hypothetical protein  44 
 
 
92 aa  63.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1559  hypothetical protein  42.65 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4028  hypothetical protein  48.72 
 
 
91 aa  54.3  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0547  acyl carrier protein  40.91 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.962654  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0559  acyl carrier protein  40.91 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13352e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1689  phosphopantetheine-binding protein  32 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.932601  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1090  hypothetical protein  32.76 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>