13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1516 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1516  globin  100 
 
 		 132 aa  274  2e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.388505  hitchhiker  0.00210145 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12550  hypothetical protein  35.43 
 
 		 130 aa  84.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3744  globin  35 
 
 		 130 aa  83.6  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1142  hypothetical protein  34.65 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.927544  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0016  hypothetical protein  32.52 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1517  hypothetical protein  34.29 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  hitchhiker  0.00388307 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3305  hypothetical protein  24.64 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634676  hitchhiker  0.000000243296 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000359  hypothetical protein  22.58 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4918  globin  25.25 
 
 		 215 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163217  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2227  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  25.51 
 
 		 379 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789146  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3847  putative globin-like protein  22.86 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0446  nitric oxide dioxygenase  25.44 
 
 		 396 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000301017  hitchhiker  0.00000364036 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1264  nitric oxide dioxygenase  25.44 
 
 		 396 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>