13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0969 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0723  hypothetical protein  84.76 
 
 
425 aa  708    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.182776  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0969  hypothetical protein  100 
 
 
411 aa  843    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0715  hypothetical protein  45 
 
 
447 aa  318  2e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000903644  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0722  putative lipoprotein  45.37 
 
 
421 aa  308  1.0000000000000001e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0474346  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0724  hypothetical protein  35.51 
 
 
434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.754516  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2480  peptidase S41  30.61 
 
 
413 aa  82  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2481  peptidase S41  29.61 
 
 
406 aa  78.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0745  peptidase S41  23.72 
 
 
435 aa  69.7  0.00000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0187  peptidase S41  22.42 
 
 
466 aa  68.6  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0329  putative lipoprotein  24.68 
 
 
612 aa  49.3  0.0001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.300764  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0871  peptidase S41  35.09 
 
 
300 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.736604 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  30.91 
 
 
418 aa  45.1  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05520  C-terminal processing peptidase  30.91 
 
 
424 aa  43.9  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>