37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0904 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0904  DhnA family protein  100 
 
 		 122 aa  246  8e-65  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06471  dihydroneopterin aldolase  24.32 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0591  dihydroneopterin aldolase  25.23 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.503596  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02300  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  28.07 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.52127  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3225  dihydroneopterin aldolase family protein  26.32 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0562  dihydroneopterin aldolase  26.79 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1910  dihydroneopterin aldolase  34.04 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1044  dihydroneopterin aldolase  30.39 
 
 		 119 aa  43.5  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00112146  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06561  dihydroneopterin aldolase  25.23 
 
 		 120 aa  43.5  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06171  dihydroneopterin aldolase  23.42 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3146  dihydroneopterin aldolase  27.5 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35620  dihydroneopterin aldolase  22.88 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.192701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3078  dihydroneopterin aldolase  27.97 
 
 		 143 aa  42  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4296  dihydroneopterin aldolase  28.21 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.505209 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0890  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  29.27 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5982  dihydroneopterin aldolase  29.75 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102976  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0317  dihydroneopterin aldolase  26.02 
 
 		 135 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0152  dihydroneopterin aldolase  23.53 
 
 		 122 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.011872  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2910  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  27.63 
 
 		 121 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.809814  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2438  dihydroneopterin aldolase  27.83 
 
 		 139 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0921  dihydroneopterin aldolase  27.59 
 
 		 119 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.294269  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2328  dihydroneopterin aldolase  32.88 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00313661  normal  0.014777 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1019  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  28.75 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4731  dihydroneopterin aldolase  26.61 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0109626  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1181  dihydroneopterin aldolase  28.75 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.918012  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2891  dihydroneopterin aldolase  28.33 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02188  hypothetical protein  27.27 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2247  dihydroneopterin aldolase  25.64 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830681  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2453  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  27.27 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000753674  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3443  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  27.27 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000963162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2679  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  27.27 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000784621  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2459  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  27.27 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00957663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1349  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  27.27 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.090335  normal  0.987888 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2597  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  27.27 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000772861  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02228  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase and dihydroneopterin aldolase  27.27 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.070307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1353  dihydroneopterin aldolase  27.27 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00304783  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1489  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  24.79 
 
 		 122 aa  40  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0254424  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>