9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0860 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0860  CheW protein  100 
 
 		 319 aa  635    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.288047  normal  0.124717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1066  CheW domain protein  30.43 
 
 		 200 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00813018  hitchhiker  0.000000321365 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2791  hypothetical protein  31.72 
 
 		 172 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2779  CheW protein  33.33 
 
 		 163 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3343  CheW protein  30 
 
 		 168 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2774  CheW protein  30 
 
 		 168 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.342659  normal  0.192178 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1428  CheW domain protein  26.72 
 
 		 177 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.201445 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3650  CheW protein  28.33 
 
 		 225 aa  46.2  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.107896  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  28.74 
 
 		 478 aa  43.9  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>