16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0730 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0730  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  361  4e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2826  hypothetical protein  35.11 
 
 
183 aa  87.8  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1317  hypothetical protein  34.9 
 
 
187 aa  86.3  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0742606 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2584  hypothetical protein  34.9 
 
 
187 aa  86.3  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.952409  normal  0.283249 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2754  hypothetical protein  34.38 
 
 
187 aa  85.1  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0729346 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2056  hypothetical protein  34.38 
 
 
187 aa  84  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0095823  normal  0.0117341 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2657  hypothetical protein  32.2 
 
 
178 aa  59.7  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3210  hypothetical protein  32.26 
 
 
188 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03900  putative bacteriophage-related protein  32.2 
 
 
178 aa  52.8  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0852  putative bacteriophage-related protein  31.64 
 
 
178 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0924412 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1890  hypothetical protein  37.93 
 
 
197 aa  44.7  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.028647  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4923  hypothetical protein  27.68 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.129768 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1169  hypothetical protein  27.51 
 
 
215 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3413  hypothetical protein  32.81 
 
 
189 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.771681  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2415  hypothetical protein  27.46 
 
 
188 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1194  hypothetical protein  33.33 
 
 
193 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0685797 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>