20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1018 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1018  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  365  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1481  hypothetical protein  46.99 
 
 
165 aa  146  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.141133  normal  0.453845 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05201  hypothetical protein  42.04 
 
 
173 aa  121  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11941  hypothetical protein  39.75 
 
 
167 aa  117  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.340527 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0475  uncharacterized membrane protein  39.75 
 
 
167 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0634074  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06261  hypothetical protein  38.85 
 
 
204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8654  normal  0.165246 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03731  hypothetical protein  33.76 
 
 
161 aa  98.6  4e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03721  hypothetical protein  33.76 
 
 
161 aa  92  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13261  hypothetical protein  30.82 
 
 
208 aa  91.3  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.556739  normal  0.107731 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0559  uncharacterized membrane protein  29.94 
 
 
208 aa  90.9  9e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0346  hypothetical protein  35.67 
 
 
161 aa  90.9  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.7083  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03751  hypothetical protein  31.21 
 
 
166 aa  84.7  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0341  hypothetical protein  29.79 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0130  hypothetical protein  28.99 
 
 
207 aa  60.8  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0443  hypothetical protein  29.1 
 
 
204 aa  57  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4948  hypothetical protein  27.22 
 
 
202 aa  54.3  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0559  hypothetical protein  30.53 
 
 
197 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0576  hypothetical protein  30.53 
 
 
197 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5152  hypothetical protein  28.65 
 
 
220 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5271  hypothetical protein  26.26 
 
 
196 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0885662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>