18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0520 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0520  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  235  2e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2157  hypothetical protein  66.1 
 
 
123 aa  142  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.363866  normal  0.120297 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05141  hypothetical protein  53.78 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15481  hypothetical protein  44.72 
 
 
127 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.225327  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18301  hypothetical protein  42.5 
 
 
126 aa  100  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.7103 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0962  hypothetical protein  42.5 
 
 
126 aa  100  7e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.754917  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16321  hypothetical protein  34.75 
 
 
123 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.387317  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1523  hypothetical protein  33.9 
 
 
123 aa  81.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0303842  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2053  hypothetical protein  39.32 
 
 
122 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16201  hypothetical protein  33.05 
 
 
123 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1349  hypothetical protein  40.52 
 
 
121 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.911576  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2077  hypothetical protein  38.46 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.050947  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16081  hypothetical protein  33.05 
 
 
123 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3445  hypothetical protein  35.9 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.705309  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3381  hypothetical protein  35.9 
 
 
122 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.458569 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2685  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  61.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2013  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000489269  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1712  hypothetical protein  37.61 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292936  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>