18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1712 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1712  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  239  1e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292936  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3381  hypothetical protein  56.2 
 
 
122 aa  143  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.458569 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2077  hypothetical protein  56.3 
 
 
122 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.050947  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3445  hypothetical protein  52.07 
 
 
121 aa  135  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.705309  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2053  hypothetical protein  56.3 
 
 
122 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2685  hypothetical protein  50.41 
 
 
121 aa  131  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2013  hypothetical protein  52.07 
 
 
121 aa  130  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000489269  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1349  hypothetical protein  51.24 
 
 
121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.911576  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15481  hypothetical protein  31.97 
 
 
127 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.225327  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05141  hypothetical protein  32.79 
 
 
126 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1523  hypothetical protein  27.12 
 
 
123 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0303842  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16201  hypothetical protein  26.27 
 
 
123 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16321  hypothetical protein  25.42 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.387317  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2157  hypothetical protein  34.07 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.363866  normal  0.120297 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0520  hypothetical protein  37.61 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0962  hypothetical protein  27.73 
 
 
126 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.754917  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18301  hypothetical protein  27.73 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.7103 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16081  hypothetical protein  30.63 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>