18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0333 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0333  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  281  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2358  hypothetical protein  77.7 
 
 
140 aa  231  3e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01331  hypothetical protein  68.35 
 
 
139 aa  207  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0474344  normal  0.486944 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26241  hypothetical protein  68.35 
 
 
139 aa  197  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.49947 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01911  hypothetical protein  58.27 
 
 
139 aa  179  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.775534 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1486  hypothetical protein  58.27 
 
 
139 aa  177  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.952228  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01341  hypothetical protein  51.15 
 
 
142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.442457  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01351  hypothetical protein  51.15 
 
 
142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0204  TPR repeat-containing protein  48.18 
 
 
140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0910  hypothetical protein  48.51 
 
 
142 aa  142  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.328003 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0120  hypothetical protein  48.09 
 
 
142 aa  141  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0411  TPR repeat-containing protein  45.26 
 
 
141 aa  140  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0422  hypothetical protein  45.26 
 
 
141 aa  140  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0819991  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2909  TPR repeat-containing protein  44.78 
 
 
139 aa  140  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298269  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4782  TPR repeat-containing protein  46.72 
 
 
140 aa  137  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01311  hypothetical protein  45.8 
 
 
142 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1288  TPR repeat-containing protein  43.07 
 
 
141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.806395 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3950  TPR repeat-containing protein  40.88 
 
 
140 aa  96.7  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174143  normal  0.0678057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>