65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2454 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2454  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  290  7e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2137  hypothetical protein  72.66 
 
 
162 aa  211  2.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27551  hypothetical protein  61.43 
 
 
167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02081  hypothetical protein  58.78 
 
 
149 aa  137  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.817359  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1557  hypothetical protein  41.01 
 
 
151 aa  133  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02661  hypothetical protein  41.01 
 
 
151 aa  130  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02081  hypothetical protein  44.2 
 
 
147 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.235056  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0192  hypothetical protein  44.2 
 
 
147 aa  118  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.373494  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02101  hypothetical protein  43.48 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0337781  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1583  hypothetical protein  41.3 
 
 
178 aa  96.3  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02191  hypothetical protein  45.86 
 
 
150 aa  93.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  45.95 
 
 
187 aa  90.5  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3779  hypothetical protein  38.46 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2062  hypothetical protein  33.33 
 
 
173 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3864  uncharacterized protein-like protein  30.22 
 
 
160 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0470  hypothetical protein  30.72 
 
 
200 aa  70.1  0.000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0466774  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3780  uncharacterized protein-like protein  28.78 
 
 
160 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0161725  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0502  hypothetical protein  37.3 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000282211 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0526  hypothetical protein  33.87 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.983156  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2870  hypothetical protein  40.22 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0163842 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4133  hypothetical protein  29.85 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000340149  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1362  hypothetical protein  29.63 
 
 
171 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3586  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000285245  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0390  hypothetical protein  27.61 
 
 
160 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.371828  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1849  hypothetical protein  33.87 
 
 
165 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3130  hypothetical protein  29.03 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121568  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2564  hypothetical protein  33.33 
 
 
234 aa  55.1  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.164456  hitchhiker  0.00170184 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0195  hypothetical protein  38.16 
 
 
218 aa  55.1  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2465  hypothetical protein  31.01 
 
 
169 aa  53.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000697447  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1133  hypothetical protein  31.25 
 
 
228 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0956  hypothetical protein  34.26 
 
 
179 aa  52.4  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0515  hypothetical protein  36.36 
 
 
210 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1383  hypothetical protein  43.42 
 
 
180 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1214  hypothetical protein  50.77 
 
 
188 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2731  hypothetical protein  40.28 
 
 
176 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5943  hypothetical protein  36.43 
 
 
177 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0572526  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  47.69 
 
 
180 aa  50.4  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  31.62 
 
 
208 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1399  hypothetical protein  30.2 
 
 
218 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1438  hypothetical protein  46.03 
 
 
196 aa  47  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  30.63 
 
 
210 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2833  hypothetical protein  37.35 
 
 
182 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0982426  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4460  hypothetical protein  45 
 
 
192 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0679  hypothetical protein  34.81 
 
 
210 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1643  Protein of unknown function DUF2062  33.78 
 
 
163 aa  45.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1152  Protein of unknown function DUF2062  28.95 
 
 
165 aa  45.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2630  hypothetical protein  30.65 
 
 
191 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662517  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  31.36 
 
 
175 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0658  hypothetical protein  31.15 
 
 
190 aa  44.7  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381208  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0651  hypothetical protein  31.15 
 
 
190 aa  44.7  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.849018  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  29.73 
 
 
177 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2626  hypothetical protein  26.45 
 
 
198 aa  43.9  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  28.83 
 
 
177 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  33.06 
 
 
186 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0898  hypothetical protein  29.69 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0947  hypothetical protein  38 
 
 
177 aa  42.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  30.65 
 
 
188 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 
395 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2575  hypothetical protein  40.91 
 
 
218 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0291416 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  27.78 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0304  hypothetical protein  40.68 
 
 
218 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.785913  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1855  hypothetical protein  33.33 
 
 
210 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1671  hypothetical protein  40.68 
 
 
218 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0658  Protein of unknown function DUF2062  38.1 
 
 
179 aa  41.6  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1386  hypothetical protein  27.78 
 
 
151 aa  40.8  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>