14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1624 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1624  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  409  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1386  hypothetical protein  61.35 
 
 
207 aa  254  8e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.192252  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09881  hypothetical protein  52.22 
 
 
213 aa  218  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11001  hypothetical protein  24.62 
 
 
214 aa  94  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.297108 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1819  hypothetical protein  26.99 
 
 
237 aa  61.6  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2609  hypothetical protein  29.03 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3497  hypothetical protein  29.03 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0168338  normal  0.306117 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2173  hypothetical protein  30.48 
 
 
238 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0838311 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14951  hypothetical protein  15.42 
 
 
210 aa  58.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.090509  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0393  hypothetical protein  27.61 
 
 
226 aa  56.6  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0663  hypothetical protein  13.71 
 
 
210 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.299064  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1292  hypothetical protein  25.51 
 
 
258 aa  46.6  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.418487  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1417  hypothetical protein  34.15 
 
 
260 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000187337  normal  0.120144 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1183  hypothetical protein  25.74 
 
 
237 aa  41.6  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>