19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1481 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1481  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  320  4e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.141133  normal  0.453845 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1018  hypothetical protein  46.99 
 
 
179 aa  146  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0475  uncharacterized membrane protein  39.04 
 
 
167 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0634074  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11941  hypothetical protein  38.36 
 
 
167 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.340527 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05201  hypothetical protein  39.33 
 
 
173 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06261  hypothetical protein  39.19 
 
 
204 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8654  normal  0.165246 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03731  hypothetical protein  34.69 
 
 
161 aa  95.5  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03751  hypothetical protein  33.78 
 
 
166 aa  90.9  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0559  uncharacterized membrane protein  34.29 
 
 
208 aa  88.6  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13261  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  89  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.556739  normal  0.107731 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03721  hypothetical protein  34.69 
 
 
161 aa  86.3  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0346  hypothetical protein  36.05 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.7083  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0341  hypothetical protein  33.74 
 
 
190 aa  68.2  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0130  hypothetical protein  37.61 
 
 
207 aa  63.9  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0443  hypothetical protein  34.41 
 
 
204 aa  49.3  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5152  hypothetical protein  30.56 
 
 
220 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4948  hypothetical protein  26.92 
 
 
202 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5271  hypothetical protein  25.88 
 
 
196 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0885662 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0576  hypothetical protein  28.57 
 
 
197 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.953247 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>