52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0974 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0974  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  448  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0887  hypothetical protein  66.67 
 
 
222 aa  311  5.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13631  hypothetical protein  59.72 
 
 
216 aa  266  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05691  hypothetical protein  54.98 
 
 
255 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.222417  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0880  Putative ParB-like nuclease  32.99 
 
 
205 aa  95.5  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141868 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0704  hypothetical protein  31.47 
 
 
205 aa  89.4  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15967  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3524  hypothetical protein  31.25 
 
 
208 aa  88.6  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940039  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56990  hypothetical protein  30.81 
 
 
228 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2187  putative ParB-like nuclease  30.77 
 
 
205 aa  86.7  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0352754  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4955  hypothetical protein  29.8 
 
 
228 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592135  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2525  hypothetical protein  29.95 
 
 
208 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0224585  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4261  putative ParB-like nuclease  29.44 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4518  putative ParB-like nuclease  27.98 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1961  hypothetical protein  29.52 
 
 
443 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0136529  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1030  hypothetical protein  29.95 
 
 
208 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.738741  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2235  Putative ParB-like nuclease  29.84 
 
 
207 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1809  hypothetical protein  29.95 
 
 
208 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1788  hypothetical protein  29.95 
 
 
208 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185204  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0136  hypothetical protein  29.95 
 
 
208 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1759  hypothetical protein  29.95 
 
 
208 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.342395  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1271  hypothetical protein  29.95 
 
 
208 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.335245  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1716  putative ParB-like nuclease  29.5 
 
 
208 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172084 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4678  hypothetical protein  29.5 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0352084  normal  0.199717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0740  Putative ParB-like nuclease  26.9 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0701  Putative ParB-like nuclease  27.27 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1514  putative ParB-like nuclease  30 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  hitchhiker  0.00751547 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1538  hypothetical protein  30 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1058  hypothetical protein  30 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0727  putative ParB-like nuclease  26.9 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  0.881395 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3351  hypothetical protein  30.1 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.789599  normal  0.0806703 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2350  Putative ParB-like nuclease  26.13 
 
 
199 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309294  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0706  hypothetical protein  27.5 
 
 
218 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0154953  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1460  putative ParB-like nuclease  27.5 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.530245  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1420  hypothetical protein  27.5 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2214  hypothetical protein  26.18 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0189524  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1668  hypothetical protein  28.23 
 
 
206 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0409439 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2660  putative ParB-like nuclease  28.92 
 
 
212 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.683597  normal  0.548694 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0264  putative lipoprotein  29.52 
 
 
380 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3403  putative lipoprotein  29.52 
 
 
380 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2351  putative lipoprotein  29.52 
 
 
380 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2530  putative lipoprotein  29.52 
 
 
380 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1126  putative lipoprotein  29.52 
 
 
380 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3368  putative lipoprotein  29.67 
 
 
380 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3409  putative lipoprotein  28.44 
 
 
380 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0653  putative ParB-like nuclease  27.36 
 
 
378 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488055  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3772  hypothetical protein  27.96 
 
 
378 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4378  hypothetical protein  26.92 
 
 
217 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0750226  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0686  hypothetical protein  27.36 
 
 
378 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1245  putative lipoprotein  28.1 
 
 
380 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0203  hypothetical protein  27.36 
 
 
378 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4374  hypothetical protein  25.12 
 
 
226 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.093636  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5254  putative ParB-like nuclease  27.23 
 
 
203 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0513173 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>