26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2167 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2167  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  239  7e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2497  hypothetical protein  72.36 
 
 		 124 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.404496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1825  hypothetical protein  72.36 
 
 		 124 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0194222  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1788  hypothetical protein  72.36 
 
 		 124 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2439  hypothetical protein  79.67 
 
 		 123 aa  183  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685345 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1781  hypothetical protein  72.36 
 
 		 124 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0111743  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1839  hypothetical protein  66.67 
 
 		 123 aa  171  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal  0.17507 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1645  hypothetical protein  69.67 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2872  hypothetical protein  68.29 
 
 		 124 aa  160  7e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1693  hypothetical protein  72.13 
 
 		 140 aa  157  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337002  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1969  hypothetical protein  66.67 
 
 		 123 aa  157  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00366875  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1753  hypothetical protein  61.79 
 
 		 125 aa  157  7e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.819388  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1647  hypothetical protein  65.85 
 
 		 126 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2421  hypothetical protein  65.85 
 
 		 126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0112375  hitchhiker  0.000913176 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2349  hypothetical protein  65.85 
 
 		 126 aa  133  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0136957  decreased coverage  0.000000000361738 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1915  hypothetical protein  54.1 
 
 		 130 aa  102  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.130481  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3192  hypothetical protein  37.4 
 
 		 131 aa  92  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0660225  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1747  hypothetical protein  57.32 
 
 		 145 aa  90.5  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2386  hypothetical protein  44.55 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02145  hypothetical protein  37.5 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0123559  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1072  hypothetical protein  37.6 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2486  hypothetical protein  55.07 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03196  hypothetical protein  47.67 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002785  hypothetical protein  48.84 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1669  membrane protein-like protein  34.25 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0706  putative transmembrane protein  26.04 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.445384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>