84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1808 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1808  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0130778  normal  0.0374625 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2836  hypothetical protein  79.89 
 
 		 179 aa  310  6.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00136132  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2522  hypothetical protein  74.58 
 
 		 179 aa  291  4e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.596229  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1944  hypothetical protein  74.01 
 
 		 179 aa  289  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.469652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2415  hypothetical protein  74.01 
 
 		 179 aa  289  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.673713  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2251  hypothetical protein  72.63 
 
 		 179 aa  286  9e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2404  hypothetical protein  73.45 
 
 		 179 aa  286  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464169  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1806  hypothetical protein  72.07 
 
 		 179 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1627  hypothetical protein  72.47 
 
 		 180 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000924391  normal  0.186435 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2169  hypothetical protein  72.88 
 
 		 185 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1727  hypothetical protein  70.39 
 
 		 179 aa  278  4e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.654156  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1540  hypothetical protein  74.01 
 
 		 179 aa  277  5e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000280033  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2292  hypothetical protein  69.49 
 
 		 179 aa  274  5e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.407638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1327  hypothetical protein  64.77 
 
 		 180 aa  258  4e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.381305 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1231  hypothetical protein  66.67 
 
 		 180 aa  254  6e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1230  hypothetical protein  66.67 
 
 		 180 aa  254  6e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00205338  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2493  hypothetical protein  66.67 
 
 		 180 aa  254  6e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.717674  hitchhiker  0.000000248387 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2018  hypothetical protein  66.67 
 
 		 180 aa  254  6e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129824 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2215  hypothetical protein  66.67 
 
 		 180 aa  254  6e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.481458  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1488  hypothetical protein  66.67 
 
 		 180 aa  254  6e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123276 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01112  hypothetical protein  66.67 
 
 		 180 aa  254  6e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2539  protein of unknown function UPF0227  66.67 
 
 		 180 aa  254  6e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0228529  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01104  hypothetical protein  66.67 
 
 		 180 aa  254  6e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1309  hypothetical protein  66.1 
 
 		 180 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000362395 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1324  hypothetical protein  66.1 
 
 		 180 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195572  hitchhiker  0.000007708 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1638  hypothetical protein  63.84 
 
 		 180 aa  248  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1975  hypothetical protein  66.1 
 
 		 180 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.82161  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1286  hypothetical protein  65.54 
 
 		 180 aa  248  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2159  hypothetical protein  65.54 
 
 		 180 aa  248  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000680398 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2487  hypothetical protein  62.15 
 
 		 180 aa  247  7e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.156401  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1925  hypothetical protein  62.71 
 
 		 180 aa  246  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.389564  hitchhiker  0.0000253614 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1623  hypothetical protein  64.41 
 
 		 180 aa  246  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003998  putative esterase  62.15 
 
 		 179 aa  245  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2793  hypothetical protein  61.58 
 
 		 180 aa  244  6.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1607  hypothetical protein  63.28 
 
 		 186 aa  243  8e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.170858  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1482  hypothetical protein  60.34 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.296836  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01524  hypothetical protein  60.34 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1310  hypothetical protein  59.89 
 
 		 183 aa  237  8e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.510559  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1701  hypothetical protein  61.58 
 
 		 180 aa  236  9e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2819  hypothetical protein  61.58 
 
 		 180 aa  236  9e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.524505 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1593  hypothetical protein  61.58 
 
 		 180 aa  236  9e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1986  hypothetical protein  56.74 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.997214  normal  0.536301 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4792  hypothetical protein  28.21 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.528676  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4916  hypothetical protein  28.35 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4969  hypothetical protein  27.69 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5697  hypothetical protein  26.94 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65670  hypothetical protein  26.94 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4708  hypothetical protein  27.18 
 
 		 202 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.731095 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0498  hypothetical protein  25 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0605  hypothetical protein  27.92 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3044  hypothetical protein  28.57 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.93923 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43490  hypothetical protein  25.52 
 
 		 205 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0772  hypothetical protein  29.94 
 
 		 191 aa  52  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.40876  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4964  hypothetical protein  26.67 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0037  protein of unknown function UPF0227  24.6 
 
 		 190 aa  51.2  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3232  hypothetical protein  30.57 
 
 		 191 aa  50.8  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0757  hypothetical protein  29.94 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.168222  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0817  hypothetical protein  30.3 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.45898  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0810  protein of unknown function UPF0227  30.3 
 
 		 191 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0617063  unclonable  0.00000000000196592 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0778  hypothetical protein  31.21 
 
 		 192 aa  48.5  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0337067  hitchhiker  0.0000000017764 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0785  hypothetical protein  30.3 
 
 		 191 aa  48.1  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.841402  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0550  hypothetical protein  26.18 
 
 		 205 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3574  hypothetical protein  29.7 
 
 		 191 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.819327  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3559  hypothetical protein  27.78 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0871904  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0729  hypothetical protein  28.39 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000799226 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0548  hypothetical protein  25.77 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.728764 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3401  hypothetical protein  22.67 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.435883  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1090  hypothetical protein  22.78 
 
 		 199 aa  45.1  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.708243 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1295  protein of unknown function UPF0227  23.49 
 
 		 186 aa  45.1  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.507685  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2774  hypothetical protein  27.55 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3900  hypothetical protein  27.74 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1294  protein of unknown function UPF0227  21.51 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.497416  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3198  hypothetical protein  25.45 
 
 		 198 aa  43.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0410762 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3693  hypothetical protein  32.32 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.695003 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0512  hypothetical protein  31.37 
 
 		 189 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2545  hypothetical protein  33.33 
 
 		 225 aa  42  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0611  hypothetical protein  26.53 
 
 		 189 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0128  hypothetical protein  26.53 
 
 		 189 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4191  hypothetical protein  27.74 
 
 		 192 aa  41.6  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0496837 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0579  hypothetical protein  26.53 
 
 		 189 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134337 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1301  hypothetical protein  30.93 
 
 		 165 aa  41.6  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.653064  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3675  protein of unknown function UPF0227  26.6 
 
 		 195 aa  41.2  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0536  hypothetical protein  30.39 
 
 		 189 aa  41.2  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.975326 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2615  protein of unknown function UPF0227  23 
 
 		 207 aa  40.8  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.83321 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>