20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0551 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0551  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  245  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4086  hypothetical protein  76.86 
 
 		 121 aa  192  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0472  hypothetical protein  72.03 
 
 		 121 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.088779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3796  hypothetical protein  72.03 
 
 		 121 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.110754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3852  hypothetical protein  72.03 
 
 		 121 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3978  hypothetical protein  71.19 
 
 		 121 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3346  hypothetical protein  71.19 
 
 		 121 aa  180  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0514  hypothetical protein  71.19 
 
 		 135 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0536  hypothetical protein  70.83 
 
 		 123 aa  179  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0213878  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3518  hypothetical protein  70.34 
 
 		 121 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0513  hypothetical protein  70.34 
 
 		 121 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.819192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0513  hypothetical protein  70.34 
 
 		 121 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3283  hypothetical protein  70.34 
 
 		 121 aa  176  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3361  hypothetical protein  68.91 
 
 		 127 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0746903 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3591  hypothetical protein  67.8 
 
 		 121 aa  170  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3192  hypothetical protein  61.86 
 
 		 123 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  29.84 
 
 		 285 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2519  hypothetical protein  27.27 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.063986  normal  0.852215 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2220  hypothetical protein  25.86 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00202987  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0160  hypothetical protein  25 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>