41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2015 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2015  integral membrane protein  100 
 
 
211 aa  406  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2417  sporulation protein YtaF  42.4 
 
 
217 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0244872 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1597  hypothetical protein  39.91 
 
 
214 aa  141  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.42174  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3270  sporulation protein YtaF  36.06 
 
 
210 aa  124  9e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000294691  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4716  hypothetical protein  35.58 
 
 
210 aa  122  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0544863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4829  hypothetical protein  36.06 
 
 
210 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0019302  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4700  hypothetical protein  36.06 
 
 
210 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2037999999999999e-32 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4315  hypothetical protein  36.06 
 
 
210 aa  122  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0571925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4480  hypothetical protein  36.06 
 
 
210 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4326  hypothetical protein  35.58 
 
 
210 aa  122  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4695  hypothetical protein  35.58 
 
 
210 aa  121  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000269761  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4710  hypothetical protein  35.58 
 
 
210 aa  121  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0031753  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0543  hypothetical protein  35.58 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0110551  hitchhiker  1.13308e-16 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1405  hypothetical protein  41.71 
 
 
203 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.27094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4415  sporulation protein YtaF  35.58 
 
 
210 aa  119  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0770529  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1890  sporulation protein YtaF  37.74 
 
 
207 aa  118  7e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0184  sporulation protein YtaF  32.26 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1839  integral membrane protein  44.23 
 
 
207 aa  114  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.167157  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04880  Sporulation protein YtaF  40.56 
 
 
219 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000954783  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2471  sporulation protein YtaF  31.88 
 
 
218 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193176  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1069  sporulation protein YtaF  32.71 
 
 
212 aa  95.1  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3212  protein of unknown function DUF204  28.5 
 
 
207 aa  91.7  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000348799  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0432  protein of unknown function DUF204  30.95 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0955  hypothetical protein  33.33 
 
 
209 aa  88.6  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0550  hypothetical protein  31.28 
 
 
203 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0469  hypothetical protein  31.75 
 
 
203 aa  88.2  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0495  hypothetical protein  31.75 
 
 
203 aa  88.2  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.207406  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0477  hypothetical protein  31.75 
 
 
203 aa  88.2  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0414  sporulation protein YtaF  31.31 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0412  integral membrane protein  31.75 
 
 
203 aa  87.8  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0234024  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0408  integral membrane protein  31.75 
 
 
203 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0550  hypothetical protein  31.28 
 
 
203 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000729048  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0499  hypothetical protein  31.28 
 
 
203 aa  87  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4823  hypothetical protein  31.28 
 
 
203 aa  85.1  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00678439  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1956  hypothetical protein  30.16 
 
 
207 aa  79  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0197086  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2330  putative sporulation protein YtaF  33.33 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.235045  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2044  putative sporulation protein YtaF  33.33 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2396  hypothetical protein  30.63 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.104879  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0423  sporulation protein YtaF  31.09 
 
 
202 aa  67  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000363461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1267  hypothetical protein  30.65 
 
 
205 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0859395  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0597  putative sporulation protein YtaF  23.9 
 
 
180 aa  45.1  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000714845  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>