13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4028 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4028  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  169  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2340  hypothetical protein  64.63 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.190465  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1932  hypothetical protein  63.16 
 
 		 92 aa  97.4  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0275  hypothetical protein  50.65 
 
 		 83 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0227705  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2433  hypothetical protein  52.44 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.776555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0698  hypothetical protein  47.56 
 
 		 83 aa  73.6  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0133  hypothetical protein  46.59 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1559  hypothetical protein  46.84 
 
 		 89 aa  69.7  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3122  hypothetical protein  45.12 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1963  hypothetical protein  44.59 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1572  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  67  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.667787  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1394  hypothetical protein  48.15 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0852964  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2521  hypothetical protein  47.56 
 
 		 83 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0165247 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>