12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2519 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2519  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  297  3e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.242712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0671  hypothetical protein  34.93 
 
 		 151 aa  97.8  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.361058  normal  0.889089 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2238  hypothetical protein  34.25 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0507  hypothetical protein  30.2 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2504  hypothetical protein  32.56 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  33.33 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  31.07 
 
 		 178 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  29.41 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  37.84 
 
 		 136 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  30 
 
 		 178 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  30.85 
 
 		 173 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  36.49 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>