24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2339 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2339  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  441  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.039929  normal  0.763516 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0589  hypothetical protein  49.78 
 
 		 232 aa  187  9e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.29516  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2012  hypothetical protein  49.04 
 
 		 229 aa  170  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal  0.0111404 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2124  lipoprotein transmembrane  30.11 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0877  hypothetical protein  26.14 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3067  putative transmembrane lipoprotein  29.15 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2878  hypothetical protein  27.71 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0924  putative transmembrane lipoprotein  26.87 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2442  lipoprotein transmembrane  29.01 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0465  putative lipoprotein  25.23 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0709301  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0163  putative lipoprotein  25.23 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0984  putative lipoprotein  25.23 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2612  putative lipoprotein  25.23 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3027  putative lipoprotein  25.23 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0879  hypothetical protein  27.54 
 
 		 233 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2981  putative lipoprotein  25.23 
 
 		 237 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0891  hypothetical protein  27.54 
 
 		 233 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2921  putative lipoprotein  24.77 
 
 		 237 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1514  hypothetical protein  26.82 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1941  lipoprotein transmembrane  25.59 
 
 		 222 aa  45.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.418069  normal  0.0186336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2264  putative lipoprotein transmembrane  25.47 
 
 		 222 aa  45.1  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0186714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0975  hypothetical protein  25 
 
 		 236 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0629475 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1016  hypothetical protein  24.52 
 
 		 236 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0537  hypothetical protein  24.52 
 
 		 236 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>