38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1472 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1472  formate dehydrogenase delta subunit  100 
 
 		 83 aa  170  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0263754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3477  putative NAD-dependent formate dehydrogenase delta subunit protein  48.57 
 
 		 76 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327274  normal  0.439831 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0837  hypothetical protein  47.89 
 
 		 76 aa  69.3  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0898913  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3658  putative NAD-dependent formate dehydrogenase  42.03 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.244302 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0736  hypothetical protein  48.61 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6062  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3087  formate dehydrogenase delta subunit  40.28 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4643  putative NAD-dependent formate dehydrogenase  40.3 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0722  NAD-dependent formate dehydrogenase delta subunit  41.79 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0621  putative NAD-dependent formate dehydrogenase delta subunit  41.54 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0807  putative NAD-dependent formate dehydrogenase  37.31 
 
 		 71 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1082  formate dehydrogenase delta subunit  36.92 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2743  NAD-dependent formate dehydrogenase, delta subunit  36.92 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.410603 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2851  hypothetical protein  43.75 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.524907  normal  0.621518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4999  hypothetical protein  39.29 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.188748  hitchhiker  0.00143677 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3923  formate dehydrogenase protein, delta subunit  34.38 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.539017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2965  formate dehydrogenase, delta subunit  33.78 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2903  formate dehydrogenase, delta subunit  33.78 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2596  formate dehydrogenase, delta subunit  33.78 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.576225  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3013  NAD-dependent formate dehydrogenase delta subunit  33.78 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0451  formate dehydrogenase, delta subunit  33.78 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.824434  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3634  NAD-dependent formate dehydrogenase, delta subunit protein  42.22 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.397021 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4407  hypothetical protein  39.66 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4915  hypothetical protein  41.3 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.633746  normal  0.374685 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4870  hypothetical protein  39.66 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0372261 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0551  hypothetical protein  30.49 
 
 		 83 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.946361  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1030  hypothetical protein  30.49 
 
 		 83 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1621  formate dehydrogenase, delta subunit  36.62 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.623732  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2895  putative NAD-dependent formate dehydrogenase delta subunit protein  33.33 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1389  formate dehydrogenase, delta subunit  38.81 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.695814  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4095  NAD-dependent formate dehydrogenase delta subunit  39.13 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.763702  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0253  hypothetical protein  28.75 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312238  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0989  hypothetical protein  29.27 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.474729  normal  0.384046 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2381  NAD-dependent formate dehydrogenase delta subunit  36.49 
 
 		 79 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1862  NAD-dependent formate dehydrogenase, delta subunit  33.87 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4143  formate dehydrogenase delta subunit  30.77 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.143558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0718  formate dehydrogenase delta subunit  33.82 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.936789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2367  formate dehydrogenase, delta subunit  30.77 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.80224 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2356  hypothetical protein  39.13 
 
 		 80 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>