21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0677 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0677  hypothetical protein  100 
 
 		 524 aa  1045    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.823751 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2710  hypothetical protein  44.08 
 
 		 519 aa  350  3e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2689  hypothetical protein  40.68 
 
 		 506 aa  308  1.0000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2690  hypothetical protein  28.49 
 
 		 498 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2711  hypothetical protein  27.67 
 
 		 474 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0676  hypothetical protein  27.83 
 
 		 454 aa  144  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2733  hypothetical protein  25.25 
 
 		 478 aa  133  9e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2788  hypothetical protein  32.82 
 
 		 484 aa  126  8.000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0973  hypothetical protein  27.59 
 
 		 485 aa  118  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.442051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1514  hypothetical protein  30.36 
 
 		 476 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.721483  normal  0.922529 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1912  hypothetical protein  23.26 
 
 		 484 aa  111  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398652  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3318  hypothetical protein  29.34 
 
 		 467 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0138  hypothetical protein  22.49 
 
 		 469 aa  98.2  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000720067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0011  hypothetical protein  22.31 
 
 		 493 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1763  hypothetical protein  27.44 
 
 		 501 aa  76.3  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1929  hypothetical protein  25.71 
 
 		 510 aa  70.1  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.696713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3680  hypothetical protein  23.56 
 
 		 506 aa  66.6  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.477628 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0471  hypothetical protein  28.26 
 
 		 373 aa  57  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2583  hypothetical protein  27.35 
 
 		 463 aa  53.9  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198931 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1113  hypothetical protein  25.79 
 
 		 392 aa  52  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1017  hypothetical protein  28.03 
 
 		 392 aa  51.2  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>