23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0676 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0676  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  919    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2711  hypothetical protein  63.29 
 
 		 474 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2690  hypothetical protein  55.81 
 
 		 498 aa  511  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2788  hypothetical protein  42.48 
 
 		 484 aa  317  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1514  hypothetical protein  40.09 
 
 		 476 aa  311  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.721483  normal  0.922529 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2733  hypothetical protein  37.28 
 
 		 478 aa  282  8.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3318  hypothetical protein  35.67 
 
 		 467 aa  264  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0973  hypothetical protein  36.75 
 
 		 485 aa  258  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.442051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1763  hypothetical protein  37.12 
 
 		 501 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0138  hypothetical protein  34.76 
 
 		 469 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000720067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1912  hypothetical protein  33.41 
 
 		 484 aa  236  8e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398652  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1929  hypothetical protein  31.57 
 
 		 510 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.696713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3680  hypothetical protein  28.16 
 
 		 506 aa  187  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.477628 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0011  hypothetical protein  27.82 
 
 		 493 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2583  hypothetical protein  28.09 
 
 		 463 aa  145  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198931 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0677  hypothetical protein  27.07 
 
 		 524 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.823751 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2689  hypothetical protein  28.85 
 
 		 506 aa  140  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2710  hypothetical protein  27.62 
 
 		 519 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1062  hypothetical protein  23.63 
 
 		 460 aa  76.3  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0471  hypothetical protein  19.93 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1017  hypothetical protein  28 
 
 		 392 aa  50.4  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1113  hypothetical protein  28 
 
 		 392 aa  49.7  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1339  hypothetical protein  26.22 
 
 		 432 aa  45.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>