38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_34230 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_34230  hypothetical protein  100 
 
 		 751 aa  1434    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.604302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0463  hypothetical protein  56.05 
 
 		 747 aa  688    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4571  hypothetical protein  45.42 
 
 		 764 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0747645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4867  hypothetical protein  45.29 
 
 		 764 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0900282 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0804  hypothetical protein  45.05 
 
 		 752 aa  485  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.613631  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4484  hypothetical protein  45.25 
 
 		 739 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1699  hypothetical protein  44.4 
 
 		 748 aa  473  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.713672 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4401  hypothetical protein  40.24 
 
 		 837 aa  460  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.433686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5054  hypothetical protein  44.2 
 
 		 751 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10879  hypothetical protein  42.84 
 
 		 756 aa  451  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.112586 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4772  hypothetical protein  42.15 
 
 		 758 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1222  hypothetical protein  41.04 
 
 		 777 aa  443  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0814  hypothetical protein  42.44 
 
 		 790 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4339  hypothetical protein  41 
 
 		 820 aa  425  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3610  hypothetical protein  42.64 
 
 		 789 aa  418  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.746479  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8905  hypothetical protein  40.23 
 
 		 789 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0172  hypothetical protein  37.78 
 
 		 876 aa  406  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.211375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3948  hypothetical protein  41.5 
 
 		 820 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3295  hypothetical protein  43.99 
 
 		 857 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3945  hypothetical protein  43.44 
 
 		 758 aa  384  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.404517  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0815  hypothetical protein  40.32 
 
 		 726 aa  372  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0508  hypothetical protein  37.7 
 
 		 759 aa  361  3e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8093  hypothetical protein  40.47 
 
 		 761 aa  360  6e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0788  hypothetical protein  35.95 
 
 		 834 aa  320  5e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0906  hypothetical protein  35.81 
 
 		 826 aa  308  3e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.504843 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0847  hypothetical protein  37.35 
 
 		 762 aa  261  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.435932  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31420  hypothetical protein  39.75 
 
 		 953 aa  253  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.937123  normal  0.115197 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0726  hypothetical protein  37.52 
 
 		 817 aa  244  6e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0231396  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2931  hypothetical protein  41.02 
 
 		 745 aa  232  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2048  hypothetical protein  29.69 
 
 		 822 aa  215  2.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21530  hypothetical protein  33.71 
 
 		 779 aa  205  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636597  hitchhiker  0.000150797 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07970  hypothetical protein  33.25 
 
 		 719 aa  193  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.281688  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2510  hypothetical protein  31.72 
 
 		 798 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90638 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3427  hypothetical protein  29.93 
 
 		 840 aa  174  6.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1999  hypothetical protein  30.34 
 
 		 856 aa  145  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0638496 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1917  hypothetical protein  26.35 
 
 		 557 aa  63.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00808951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  30.92 
 
 		 558 aa  46.6  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  29.61 
 
 		 550 aa  45.8  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>