30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_34170 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_34170  molybdopterin converting factor, small subunit  100 
 
 		 103 aa  199  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.176144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0470  thiamineS protein  63.41 
 
 		 87 aa  88.6  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4962  thiamineS protein  49.4 
 
 		 82 aa  78.6  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.806952  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0822  thiamineS protein  55.7 
 
 		 79 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0182275  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4478  thiamineS  49.38 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605033  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4861  thiamineS protein  49.38 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0539176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4565  thiamineS protein  49.38 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5048  thiamineS protein  49.38 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1704  thiamineS protein  49.38 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4752  thiamineS protein  44.9 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1232  thiamine S protein  51.9 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5047  thiamineS protein  45.78 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107855 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10885  molybdenum cofactor biosynthesis protein D 2 moaD2  50.62 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.91513e-26  normal  0.142298 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1754  thiamineS protein  41.46 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.593582  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4537  thiamineS protein  44.57 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.708821 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1443  thiamineS protein  50 
 
 		 88 aa  52  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000277571 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2024  thiamineS protein  43.9 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.930246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1691  thiamineS protein  36.78 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.319795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20020  hypothetical protein  35.37 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891223 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08550  ThiS family protein  40.35 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.266586  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1833  thiamineS protein  42.65 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.308213  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0596  thiamineS protein  42.86 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0445  thiamine S  39.56 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1439  thiamineS protein  45.35 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0227652  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4239  thiamineS protein  35.11 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.312253  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1889  MoaD family protein  32.93 
 
 		 86 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000141172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0356  thiamineS protein  38.6 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1160  molybdopterin converting factor, subunit 1  41.46 
 
 		 223 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.60051 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1248  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.68 
 
 		 217 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.460975  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1180  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.44 
 
 		 217 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>