12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28320 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_28320  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  265  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2804  hypothetical protein  45.3 
 
 		 151 aa  90.9  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1967  hypothetical protein  37.21 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000966023  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0773  hypothetical protein  40.65 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5920  hypothetical protein  36.78 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.159074 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0396  hypothetical protein  38.78 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0697  hypothetical protein  32.63 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.756425 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4613  hypothetical protein  28.23 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.787704  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0199  hypothetical protein  40 
 
 		 128 aa  52.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4824  hypothetical protein  26.27 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1909  hypothetical protein  28.33 
 
 		 144 aa  42.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.409563  normal  0.294721 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0084  hypothetical protein  32.5 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>