31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_16870 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_16870  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  405  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541123  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1798  hypothetical protein  61.33 
 
 		 194 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0571  hypothetical protein  53.41 
 
 		 191 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0889  hypothetical protein  47.57 
 
 		 272 aa  165  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7897  hypothetical protein  46.63 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3582  hypothetical protein  48.89 
 
 		 194 aa  158  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2738  hypothetical protein  47.75 
 
 		 198 aa  156  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6481  hypothetical protein  45.86 
 
 		 299 aa  155  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459745  normal  0.157533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0331  hypothetical protein  43.28 
 
 		 366 aa  151  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0809  hypothetical protein  42.37 
 
 		 189 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.184742  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3962  hypothetical protein  47.12 
 
 		 194 aa  144  9e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0478581  normal  0.244744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0989  hypothetical protein  43.41 
 
 		 183 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2833  hypothetical protein  45.56 
 
 		 231 aa  132  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.281576  decreased coverage  0.00256683 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0979  hypothetical protein  42.86 
 
 		 183 aa  131  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128032  normal  0.0985074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0961  hypothetical protein  42.86 
 
 		 183 aa  131  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193849  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4387  hypothetical protein  40.56 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1702  hypothetical protein  36.09 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0196867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1190  hypothetical protein  27.59 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1652  hypothetical protein  28.73 
 
 		 278 aa  55.1  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0147  hypothetical protein  29.77 
 
 		 311 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000766402  normal  0.195147 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0483  hypothetical protein  32.35 
 
 		 272 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2769  hypothetical protein  29.29 
 
 		 267 aa  53.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0142  hypothetical protein  28.37 
 
 		 286 aa  51.6  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2864  hypothetical protein  27.59 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.197887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4055  hypothetical protein  28.99 
 
 		 271 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.851033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0160  hypothetical protein  27.41 
 
 		 287 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.751765  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5534  hypothetical protein  24.06 
 
 		 259 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0149  hypothetical protein  27.41 
 
 		 304 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0510  hypothetical protein  26.21 
 
 		 223 aa  46.2  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.445932  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0530  hypothetical protein  26.11 
 
 		 246 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1090  hypothetical protein  31.63 
 
 		 171 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>