48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_16570 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_16570  uncharacterized small protein  100 
 
 		 77 aa  160  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1939  protein of unknown function DUF466  50 
 
 		 71 aa  64.7  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294211  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1573  hypothetical protein  54.72 
 
 		 61 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.197269  normal  0.788025 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08620  uncharacterized small protein  43.48 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2309  protein of unknown function DUF466  42.19 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000163671  hitchhiker  0.00083492 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3362  protein of unknown function DUF466  42.59 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.280192  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0832  hypothetical protein  37.1 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.619207 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3106  protein of unknown function DUF466  43.33 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0421  hypothetical protein  44.62 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.849917  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0682  hypothetical protein  37.7 
 
 		 63 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.643858  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0645  hypothetical protein  36.67 
 
 		 65 aa  50.8  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0861404  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15000  hypothetical protein  41.67 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344355  normal  0.519615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0335  protein of unknown function DUF466  40 
 
 		 109 aa  50.1  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2018  hypothetical protein  40.85 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0752714  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1907  hypothetical protein  40.85 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.063511  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0684  hypothetical protein  37.1 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00555  hypothetical protein  37.1 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.406508  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00566  hypothetical protein  37.1 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.559075  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0619  hypothetical protein  37.1 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.593991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0501  hypothetical protein  37.1 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0650  hypothetical protein  37.1 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3026  protein of unknown function DUF466  37.1 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3045  hypothetical protein  37.1 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0619  hypothetical protein  37.1 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2242  hypothetical protein  40 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0770817 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0654  hypothetical protein  36.07 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0713  hypothetical protein  36.07 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.885775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0759  hypothetical protein  36.07 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0640  hypothetical protein  36.07 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0697  hypothetical protein  36.07 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0939603 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5299  hypothetical protein  31.34 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178014  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4711  hypothetical protein  31.34 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5433  hypothetical protein  31.34 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3246  hypothetical protein  31.34 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710671  normal  0.40045 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0098  hypothetical protein  31.34 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3981  protein of unknown function DUF466  36.36 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.255215  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1131  hypothetical protein  32.79 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4323  hypothetical protein  44.44 
 
 		 45 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1187  protein of unknown function DUF466  30.65 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00439042  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3416  hypothetical protein  34.55 
 
 		 64 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.700053  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3377  hypothetical protein  45.45 
 
 		 70 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2016  hypothetical protein  36.73 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2293  protein of unknown function DUF466  36.73 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1797  hypothetical protein  42.22 
 
 		 45 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13548  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3573  hypothetical protein  32.73 
 
 		 64 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1844  hypothetical protein  42.22 
 
 		 45 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.598922  normal  0.978104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1778  hypothetical protein  42.22 
 
 		 45 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.380449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1978  protein of unknown function DUF466  40 
 
 		 77 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.89356  normal  0.275642 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>