24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_15570 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_15570  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  326  7e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.581223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5243  hypothetical protein  46.91 
 
 		 163 aa  154  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4277  hypothetical protein  47.33 
 
 		 174 aa  121  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.333578 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2406  putative export or membrane protein  37.82 
 
 		 166 aa  113  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2365  putative export or membrane protein  37.82 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.403304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2412  putative export or membrane protein  37.82 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2338  hypothetical protein  43.7 
 
 		 184 aa  110  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2001  hypothetical protein  39.86 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124511 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1844  hypothetical protein  43.08 
 
 		 183 aa  108  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.933293  normal  0.367059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2662  putative export or membrane protein  36.54 
 
 		 167 aa  107  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3745  putative export or membrane protein  35.9 
 
 		 167 aa  105  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291225  normal  0.0249231 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11411  hypothetical protein  33.77 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0169137  normal  0.182587 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2264  hypothetical protein  37.06 
 
 		 172 aa  92.8  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116148  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2036  hypothetical protein  39.2 
 
 		 187 aa  91.3  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0150137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2403  hypothetical protein  39.72 
 
 		 185 aa  87.4  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3200  hypothetical protein  36.67 
 
 		 351 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00811968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14750  hypothetical protein  39.84 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.361385  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1323  hypothetical protein  34.25 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.248263 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17980  hypothetical protein  30.07 
 
 		 188 aa  73.9  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1708  hypothetical protein  31.65 
 
 		 591 aa  70.9  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.864094  normal  0.0229836 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12600  hypothetical protein  36.22 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0565366  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2583  hypothetical protein  37.86 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1710  hypothetical protein  34.23 
 
 		 209 aa  64.3  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0354776  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3003  hypothetical protein  35.24 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.767644 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>