34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1708 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1708  hypothetical protein  100 
 
 		 591 aa  1134    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.864094  normal  0.0229836 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3200  hypothetical protein  76.65 
 
 		 351 aa  246  9e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00811968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4277  hypothetical protein  32.52 
 
 		 174 aa  80.9  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.333578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5243  hypothetical protein  39.86 
 
 		 163 aa  78.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2338  hypothetical protein  29.79 
 
 		 184 aa  78.2  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2365  putative export or membrane protein  30.13 
 
 		 166 aa  78.2  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.403304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2412  putative export or membrane protein  30.13 
 
 		 166 aa  78.2  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2406  putative export or membrane protein  29.49 
 
 		 166 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15570  hypothetical protein  30.57 
 
 		 163 aa  75.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.581223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3745  putative export or membrane protein  30.82 
 
 		 167 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291225  normal  0.0249231 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11411  hypothetical protein  32.19 
 
 		 165 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0169137  normal  0.182587 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2264  hypothetical protein  33.12 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116148  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2662  putative export or membrane protein  30.82 
 
 		 167 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1323  hypothetical protein  26.83 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.248263 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2001  hypothetical protein  32.28 
 
 		 172 aa  70.1  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124511 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2900  hypothetical protein  33.33 
 
 		 793 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.366877  normal  0.180357 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10310  PPE family protein  24.42 
 
 		 3166 aa  60.5  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.395007 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10360  PPE family protein  24.22 
 
 		 3295 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.683224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2403  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  55.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13376  PPE family protein  26.4 
 
 		 2532 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0812485  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13381  PPE family protein  23.71 
 
 		 647 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00213792  normal  0.0214486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13386  PPE family protein  22.99 
 
 		 3787 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000441987 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17980  hypothetical protein  28.22 
 
 		 188 aa  52.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2036  hypothetical protein  27.33 
 
 		 187 aa  52  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0150137 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2583  hypothetical protein  27.86 
 
 		 163 aa  52  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11946  PPE family protein  23.28 
 
 		 1457 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.515956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11771  PPE family protein  23.11 
 
 		 975 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.49393e-28  hitchhiker  0.0000000153091 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1844  hypothetical protein  29.77 
 
 		 183 aa  48.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.933293  normal  0.367059 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13380  PPE family protein  25.98 
 
 		 2472 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.21147  normal  0.142656 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1851  pentapeptide repeat-containing protein  36.36 
 
 		 551 aa  47.4  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000406154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13566  PPE family protein  26.73 
 
 		 582 aa  47  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.514261  hitchhiker  0.0000000713233 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1710  hypothetical protein  29.31 
 
 		 209 aa  45.4  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0354776  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1817  hypothetical protein  19.83 
 
 		 486 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02790  hypothetical protein  29.2 
 
 		 349 aa  44.7  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.874218  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>