16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_05930 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_05930  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  368  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6386  hypothetical protein  49.31 
 
 		 163 aa  124  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.320315  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4831  hypothetical protein  34.91 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000648077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9190  hypothetical protein  31.3 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0481  hypothetical protein  32.98 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571872  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0934  hypothetical protein  35.48 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9099  hypothetical protein  34.02 
 
 		 134 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8102  hypothetical protein  30.21 
 
 		 134 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4870  hypothetical protein  36.47 
 
 		 119 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2087  hypothetical protein  34 
 
 		 107 aa  45.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114864  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  31.52 
 
 		 118 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8485  hypothetical protein  32.46 
 
 		 137 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22000  hypothetical protein  25 
 
 		 109 aa  42.4  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0535  hypothetical protein  36.99 
 
 		 147 aa  41.6  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000537428  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2153  hypothetical protein  34.21 
 
 		 152 aa  41.2  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14040  hypothetical protein  34.18 
 
 		 174 aa  40.8  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.593323 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>