23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01250 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_01250  protein of unknown function (DUF350)  100 
 
 		 148 aa  282  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.993492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0116  protein of unknown function DUF350  69.44 
 
 		 150 aa  175  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1574  protein of unknown function DUF350  54.55 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00727818  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2364  hypothetical protein  40.28 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7052  hypothetical protein  37.67 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4693  hypothetical protein  39.86 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12619  integral membrane protein  37.59 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.951061  normal  0.527246 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0865  hypothetical protein  37.12 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.94497 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2235  hypothetical protein  39.64 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1863  hypothetical protein  39.01 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513538  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1883  hypothetical protein  38.3 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0848062  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1929  hypothetical protein  38.3 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2756  protein of unknown function DUF350  32.81 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1155  protein of unknown function DUF350  32 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.735897  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0702  protein of unknown function DUF350  32.85 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.406118  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5175  protein of unknown function DUF350  33.04 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2138  protein of unknown function DUF350  32.82 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0124  hypothetical protein  40.66 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0681  protein of unknown function DUF350  26.47 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1314  hypothetical protein  26.98 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00268804  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1640  hypothetical protein  24.03 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.147594  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1785  protein of unknown function DUF350  29.23 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1502  hypothetical protein  23.2 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.828357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>