10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_R0003 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_R0003  tRNA-Cys  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00040778  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1787  tRNA-Cys  87.69 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.232461  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  84.51 
 
 
71 bp  54  0.000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0065  tRNA-Cys  96.67 
 
 
75 bp  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000051222  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1652  tRNA-Cys  84.62 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0015  tRNA-Cys  84.62 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000242975  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0001  tRNA-Cys  91.67 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.364901  hitchhiker  0.00165613 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0026  tRNA-Cys  93.33 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0084  tRNA-Cys  93.33 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0020  tRNA-Cys  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0214186 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>