28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4537 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4537  thiamineS protein  100 
 
 		 98 aa  194  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.708821 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5047  thiamineS protein  80.81 
 
 		 99 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107855 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4962  thiamineS protein  55.42 
 
 		 82 aa  85.5  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.806952  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0470  thiamineS protein  47.06 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34170  molybdopterin converting factor, small subunit  44.57 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.176144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1691  thiamineS protein  44.94 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.319795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4752  thiamineS protein  47.25 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4861  thiamineS protein  46.43 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0539176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4565  thiamineS protein  46.43 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4478  thiamineS  46.43 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605033  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2024  thiamineS protein  43.18 
 
 		 92 aa  51.2  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.930246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0445  thiamine S  42.86 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1704  thiamineS protein  46.91 
 
 		 82 aa  48.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1754  thiamineS protein  43.9 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.593582  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5048  thiamineS protein  43.18 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10885  molybdenum cofactor biosynthesis protein D 2 moaD2  46.34 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.91513e-26  normal  0.142298 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1439  thiamineS protein  43.18 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0227652  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19310  molybdopterin converting factor, small subunit  43.86 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0344734  normal  0.0247998 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0159  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.35 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222871  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0356  thiamineS protein  46.81 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0822  thiamineS protein  51.19 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0182275  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3626  thiamineS protein  48.39 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.014511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20020  hypothetical protein  41.98 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891223 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1243  hypothetical protein  37.04 
 
 		 84 aa  42  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00015012  normal  0.456438 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2736  putative molybdopterin converting factor  37.11 
 
 		 102 aa  41.2  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1232  thiamine S protein  56.41 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4239  thiamineS protein  39.08 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.312253  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8251  thiamineS protein  48.75 
 
 		 83 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>