9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4300 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4300  hypothetical protein  100 
 
 		 644 aa  1292    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.908642  normal  0.295604 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4736  hypothetical protein  87.44 
 
 		 643 aa  1085    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0485  hypothetical protein  42.74 
 
 		 623 aa  428  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0404409 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07290  hypothetical protein  28.76 
 
 		 642 aa  139  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0887  hypothetical protein  27.66 
 
 		 647 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1101  hypothetical protein  25.17 
 
 		 782 aa  84.3  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3056  hypothetical protein  22.87 
 
 		 657 aa  60.1  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.98238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8471  hypothetical protein  25.66 
 
 		 812 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503181  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0146  hypothetical protein  23.06 
 
 		 782 aa  48.5  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>