24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2149 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2149  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  292  8e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167066  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3329  hypothetical protein  50.75 
 
 		 142 aa  156  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3744  phosphoribosyltransferase-like protein  43.45 
 
 		 418 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0623345 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0342  hypothetical protein  40.3 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1372  hypothetical protein  38.36 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2135  hypothetical protein  39.53 
 
 		 151 aa  94.4  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2280  hypothetical protein  38.89 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1294  hypothetical protein  32.85 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0137379  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3607  hypothetical protein  36.36 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.9799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2092  hypothetical protein  31.21 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3765  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1403  hypothetical protein  37.96 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.628547  normal  0.692701 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0392  hypothetical protein  32.84 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.2643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2062  hypothetical protein  29.77 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0457353  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13970  hypothetical protein  30.33 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.607556 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46310  hypothetical protein  28.89 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.123911  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4776  hypothetical protein  27.34 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268249 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2467  hypothetical protein  30.37 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0076  hypothetical protein  28.67 
 
 		 168 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0925  hypothetical protein  32.43 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3527  hypothetical protein  34.07 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1455  hypothetical protein  30.28 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0296741  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0380  hypothetical protein  26.47 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2121  hypothetical protein  27 
 
 		 196 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277797  normal  0.0126504 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>