28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2121 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2121  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  388  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277797  normal  0.0126504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2265  hypothetical protein  86.76 
 
 		 136 aa  226  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.210713  normal  0.0751956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9020  hypothetical protein  42.74 
 
 		 124 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1455  hypothetical protein  39.68 
 
 		 133 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0296741  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4770  hypothetical protein  34.15 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.444502  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3998  hypothetical protein  45.79 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3823  Protein of unknown function DUF2267  36 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3361  hypothetical protein  35.54 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0648  Protein of unknown function DUF2267  38.52 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270306  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07750  hypothetical protein  38.28 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2270  hypothetical protein  38.58 
 
 		 133 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000078437  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0721  hypothetical protein  38.33 
 
 		 127 aa  63.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0171189  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4495  hypothetical protein  33.6 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7349  hypothetical protein  35.16 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9245  hypothetical protein  34.68 
 
 		 268 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3703  Protein of unknown function DUF2267  36.45 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3772  Protein of unknown function DUF2267  30.43 
 
 		 172 aa  52.8  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2011  CBS domain-containing protein  36 
 
 		 286 aa  50.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13970  hypothetical protein  30 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.607556 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1372  hypothetical protein  35.85 
 
 		 161 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3607  hypothetical protein  35.51 
 
 		 141 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.9799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2280  hypothetical protein  30.83 
 
 		 142 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0342  hypothetical protein  26.4 
 
 		 146 aa  45.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1294  hypothetical protein  26.87 
 
 		 145 aa  45.8  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0137379  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2092  hypothetical protein  31.54 
 
 		 144 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3744  phosphoribosyltransferase-like protein  31.09 
 
 		 418 aa  44.7  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0623345 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1403  hypothetical protein  32.54 
 
 		 141 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.628547  normal  0.692701 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3329  hypothetical protein  26.67 
 
 		 142 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>