21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1981 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1981  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  226  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.510264  normal  0.259293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0039  XRE family transcriptional regulator  60 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2907  hypothetical protein  65.59 
 
 		 111 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4340  hypothetical protein  46.36 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.316173  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2201  hypothetical protein  46.36 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911557  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2642  XRE family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 119 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06650  hypothetical protein  41.28 
 
 		 112 aa  87.4  6e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2599  hypothetical protein  41.94 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2643  hypothetical protein  41.94 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0926652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0385  hypothetical protein  58.33 
 
 		 81 aa  78.2  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4582  hypothetical protein  44.29 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.804527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0475  hypothetical protein  42.42 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5942  hypothetical protein  42.42 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.967814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0581  hypothetical protein  42.42 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4726  hypothetical protein  32.35 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.227983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5551  hypothetical protein  37.5 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.074617 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4217  hypothetical protein  29.79 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4275  hypothetical protein  29.29 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2541  XRE family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2736  XRE family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3446  XRE family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.256834  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>