23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1756 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1756  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  273  7e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.721453  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1742  hypothetical protein  90.3 
 
 
137 aa  249  9.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198279  hitchhiker  0.00269492 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14450  hypothetical protein  66.41 
 
 
136 aa  176  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.408221  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2742  ChaB family protein  66.67 
 
 
131 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.764397  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3652  ChaB  62.5 
 
 
139 aa  167  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3725  ChaB family protein  62.5 
 
 
139 aa  167  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1804  hypothetical protein  65 
 
 
133 aa  164  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3665  ChaB family protein  60.94 
 
 
139 aa  161  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4587  ChaB family protein  62.22 
 
 
138 aa  161  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3411  hypothetical protein  62.31 
 
 
141 aa  161  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5498  hypothetical protein  65.29 
 
 
130 aa  161  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00390859  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0793  ChaB family protein  59.38 
 
 
139 aa  157  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0893  hypothetical protein  61.19 
 
 
134 aa  155  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2019  ChaB family protein  59.29 
 
 
142 aa  150  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742631  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0871  ChaB family protein  58.59 
 
 
140 aa  149  8.999999999999999e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3007  ChaB family protein  60.47 
 
 
141 aa  147  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000471912  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4490  ChaB family protein  61.72 
 
 
134 aa  147  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0526847 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02480  ChaB protein  56.69 
 
 
141 aa  144  5e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1538  hypothetical protein  63.85 
 
 
153 aa  140  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.213562  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0646  hypothetical protein  60.53 
 
 
97 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212732  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64490  hypothetical protein  35.82 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23330  hypothetical protein  62.07 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1703  hypothetical protein  56.41 
 
 
286 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.735506  normal  0.119143 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>