9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0258 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0258  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  238  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.990108  normal  0.0309417 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0300  hypothetical protein  91.67 
 
 		 120 aa  180  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0391304 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0343  hypothetical protein  46.77 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.84343  hitchhiker  0.00208243 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4345  hypothetical protein  45.61 
 
 		 104 aa  47  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.1779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2967  hypothetical protein  45.83 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179901 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3954  hypothetical protein  40.62 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3961  hypothetical protein  40.62 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6222  hypothetical protein  44.16 
 
 		 197 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1519  hypothetical protein  40.74 
 
 		 107 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0202167 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>