15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2872 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0597  transposase, IS605 OrfB family  93.47 
 
 
1125 bp  1675    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000997644  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0601  transposase, IS605 OrfB family  93.11 
 
 
1200 bp  1727    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000137299  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0628  transposase, IS605 OrfB family  91.7 
 
 
1236 bp  1584    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0956    88.13 
 
 
1290 bp  805    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2156  transposase, IS605 OrfB family  90.25 
 
 
1182 bp  1409    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2438  transposase, IS605 OrfB family  94.1 
 
 
1176 bp  1768    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.258594  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2454  transposase, IS605 OrfB family  94.09 
 
 
1188 bp  1818    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.1066  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2633  transposase, IS605 OrfB family  93.74 
 
 
1119 bp  1626    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.56671  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2849  transposase, IS605 OrfB family  90.08 
 
 
1209 bp  1413    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2872    100 
 
 
1202 bp  2383    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0386  IS605 family transposase OrfB  84 
 
 
1185 bp  143  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0373    81.68 
 
 
4490 bp  101  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.221643  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2464    84.96 
 
 
4069 bp  89.7  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2548  hypothetical protein  93.88 
 
 
279 bp  73.8  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.015357  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2193    83.19 
 
 
237 bp  71.9  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.985679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>