23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2503 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0534    97.94 
 
 
1069 bp  1146    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2590    98.15 
 
 
1949 bp  795    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1496    94.82 
 
 
2432 bp  940    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2045    91.13 
 
 
973 bp  712    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0267006  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2259    97.52 
 
 
1069 bp  1152    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2503    100 
 
 
1138 bp  2256    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2381    98.04 
 
 
985 bp  1023    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2486  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.74 
 
 
1068 bp  1183    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.0095339  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2731  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  88.61 
 
 
1074 bp  170  5.9999999999999996e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0404628  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2520    98.85 
 
 
1222 bp  165  3e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2165    100 
 
 
5958 bp  157  8e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2166    100 
 
 
4516 bp  157  8e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2264    100 
 
 
1029 bp  157  8e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0724    98.73 
 
 
2092 bp  149  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00877806  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2390    96.59 
 
 
1348 bp  143  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2359    97.47 
 
 
903 bp  141  5e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2749  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  78.81 
 
 
1074 bp  137  7.999999999999999e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2464    96.2 
 
 
4069 bp  133  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0806  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  81.63 
 
 
1068 bp  103  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.268698  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0335  hypothetical protein  98.18 
 
 
132 bp  101  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.813334  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2502  Transposase, ISC1217  96.36 
 
 
636 bp  93.7  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2380  transposase IS4 family protein  93.88 
 
 
870 bp  65.9  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0744    91.11 
 
 
922 bp  58  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0103868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>